23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0762 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0942  hypothetical protein  73.41 
 
 		 466 aa  726    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3457  hypothetical protein  72.87 
 
 		 475 aa  723    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0887  hypothetical protein  78.34 
 
 		 461 aa  767    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3651  hypothetical protein  72.87 
 
 		 467 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.270558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0795  hypothetical protein  74.16 
 
 		 477 aa  754    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0885  hypothetical protein  80.31 
 
 		 461 aa  776    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3532  hypothetical protein  73.09 
 
 		 467 aa  724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0882  hypothetical protein  71.73 
 
 		 467 aa  724    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0762  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  978    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0835  hypothetical protein  72.87 
 
 		 467 aa  721    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2747  hypothetical protein  64.95 
 
 		 467 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3341  hypothetical protein  73.41 
 
 		 465 aa  728    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0655  hypothetical protein  68.09 
 
 		 480 aa  679    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.166007  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3238  hypothetical protein  73.19 
 
 		 465 aa  726    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0785  hypothetical protein  73.19 
 
 		 466 aa  726    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0742  hypothetical protein  70.56 
 
 		 463 aa  712    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.580335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3388  hypothetical protein  46.41 
 
 		 486 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2634  hypothetical protein  45.47 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0414  hypothetical protein  45.43 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0456843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1725  hypothetical protein  36.69 
 
 		 451 aa  340  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003423  hypothetical protein  35.11 
 
 		 450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02355  hypothetical protein  35.33 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1113  hypothetical protein  33.26 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>