54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000257 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000257  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  604  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4897  hypothetical protein  26.63 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  24.84 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56220  hypothetical protein  26.04 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  21.72 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38400  universal stress protein family  25.52 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1044  universal stress protein UspE  25.48 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.106711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3260  UspA domain-containing protein  22.09 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  25.16 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  22.22 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  22.56 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  22.89 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003476  universal stress protein E  23.88 
 
 		 254 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.181718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0988  UspA domain-containing protein  22.09 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  22.29 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1851  universal stress protein UspE  23.67 
 
 		 316 aa  49.3  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  22.29 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  22.64 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  22.64 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  22.64 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  22.64 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  21.34 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  23.9 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  23.17 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0884  UspA domain-containing protein  21.25 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1863  universal stress protein UspE  23.08 
 
 		 319 aa  46.2  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.809514  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  22.01 
 
 		 310 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  22.01 
 
 		 310 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  22.01 
 
 		 310 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  20.38 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  22.01 
 
 		 310 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2106  universal stress protein UspE  22.49 
 
 		 316 aa  45.8  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0879  universal stress protein UspE  22.54 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0349688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2399  universal stress protein UspE  22.49 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2080  universal stress protein UspE  24.26 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  20.73 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2065  universal stress protein UspE  18.9 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1784  universal stress protein UspE  23.08 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334213  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1846  universal stress protein UspE  23.08 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1786  universal stress protein UspE  23.08 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02064  universal stress protein UspE  20.38 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00593148  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1490  universal stress protein UspE  23.08 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0578551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1672  universal stress protein UspE  23.08 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0632813 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01320  hypothetical protein  22.49 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1449  universal stress protein UspE  22.49 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1980  universal stress protein UspE  22.49 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.420697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1789  universal stress protein UspE  22.49 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2292  universal stress protein UspE  22.49 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01310  stress-induced protein  22.49 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2312  UspA domain protein  22.49 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.172993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1545  universal stress protein UspE  23.12 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 166 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 166 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1041  UspA domain-containing protein  20 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>