73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0194 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  892    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  94.27 
 
 
455 aa  796    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  43.14 
 
 
456 aa  322  8e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  39.22 
 
 
462 aa  311  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  37.09 
 
 
462 aa  239  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  32.62 
 
 
461 aa  190  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  31.43 
 
 
459 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  30.42 
 
 
542 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  31.51 
 
 
622 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  30.97 
 
 
463 aa  169  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  30.59 
 
 
530 aa  162  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  31.83 
 
 
467 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  30.15 
 
 
611 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  28.69 
 
 
532 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  32.03 
 
 
527 aa  156  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  26.55 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  27.65 
 
 
656 aa  147  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  29.67 
 
 
653 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  28.94 
 
 
546 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  32.44 
 
 
660 aa  133  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  28.45 
 
 
546 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  33.53 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  29.85 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  29.94 
 
 
501 aa  130  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  27.04 
 
 
544 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000393022  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  26.58 
 
 
634 aa  129  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  29.63 
 
 
538 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  28.23 
 
 
545 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  27.86 
 
 
484 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  29.32 
 
 
562 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  30.13 
 
 
520 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  27.7 
 
 
525 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  27.37 
 
 
529 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  31.94 
 
 
509 aa  114  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  29.44 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  25.21 
 
 
556 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  25.97 
 
 
565 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  25.16 
 
 
556 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  27.03 
 
 
578 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  29.43 
 
 
556 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  27.97 
 
 
534 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  25.26 
 
 
562 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  27.21 
 
 
555 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  26.75 
 
 
562 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  27.62 
 
 
563 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  27.62 
 
 
563 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  28.61 
 
 
381 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  27.35 
 
 
563 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  28.77 
 
 
555 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  26.72 
 
 
562 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000204321 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  27.7 
 
 
728 aa  92  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  26.72 
 
 
562 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  30.21 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  26.72 
 
 
562 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  26.72 
 
 
562 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  27.93 
 
 
563 aa  90.9  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  25.28 
 
 
554 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000996  predicted polymerase  28.21 
 
 
559 aa  86.7  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  22.96 
 
 
551 aa  85.9  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  29.96 
 
 
556 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2318  hypothetical protein  30.87 
 
 
371 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  24.44 
 
 
552 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07053  hypothetical protein  30.8 
 
 
566 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0394  hypothetical protein  32.78 
 
 
543 aa  79.7  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000249945  normal  0.153411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  27.95 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  29.3 
 
 
603 aa  77  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  24.77 
 
 
629 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0823  hypothetical protein  31.67 
 
 
691 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00604121  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0429  hypothetical protein  27.41 
 
 
574 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  28.42 
 
 
603 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  26.17 
 
 
371 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  23.7 
 
 
547 aa  59.7  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4099  protein of unknown function DUF342  24.88 
 
 
598 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000308473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>