69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1695 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1152    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000996  predicted polymerase  45.34 
 
 		 559 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717686  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07053  hypothetical protein  44.24 
 
 		 566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  44.6 
 
 		 556 aa  455  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  35.08 
 
 		 547 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  37.45 
 
 		 556 aa  297  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  35.89 
 
 		 562 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000204321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  35.89 
 
 		 562 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  35.89 
 
 		 562 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  35.89 
 
 		 562 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  36.01 
 
 		 556 aa  279  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  36.44 
 
 		 562 aa  279  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  35.89 
 
 		 563 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  35.68 
 
 		 563 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  35.68 
 
 		 563 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  35.73 
 
 		 556 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  35.48 
 
 		 563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  33.61 
 
 		 554 aa  272  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  34.71 
 
 		 555 aa  267  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  34.24 
 
 		 555 aa  263  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  33.54 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  29.84 
 
 		 562 aa  236  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  27.34 
 
 		 552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  29.13 
 
 		 551 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  31.36 
 
 		 546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  26.74 
 
 		 546 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  31.27 
 
 		 544 aa  169  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000393022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  28.19 
 
 		 565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  29.75 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  28.97 
 
 		 534 aa  156  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  31.84 
 
 		 541 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  26.59 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  29.1 
 
 		 538 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  25.93 
 
 		 542 aa  128  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  28.57 
 
 		 461 aa  128  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  25.72 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  28.95 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  25.8 
 
 		 611 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  28.47 
 
 		 527 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  26.27 
 
 		 532 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  29.48 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  26.44 
 
 		 622 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  25.68 
 
 		 462 aa  113  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  27.37 
 
 		 660 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  25.26 
 
 		 656 aa  111  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  25.15 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000175912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  26.77 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  25.3 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  24.48 
 
 		 501 aa  91.3  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  26.82 
 
 		 484 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  24.28 
 
 		 529 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  29.75 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  27.59 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  23.58 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0823  hypothetical protein  29.96 
 
 		 691 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00604121  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  22.75 
 
 		 578 aa  78.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  25.63 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  23.53 
 
 		 634 aa  77  0.0000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  21.84 
 
 		 728 aa  69.7  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  24.28 
 
 		 629 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  25.79 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  30.59 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  24.48 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  27.05 
 
 		 603 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  20.74 
 
 		 653 aa  63.9  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0394  hypothetical protein  28.18 
 
 		 543 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000249945  normal  0.153411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0429  hypothetical protein  27.53 
 
 		 574 aa  57  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4099  protein of unknown function DUF342  25 
 
 		 598 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000308473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  23.03 
 
 		 378 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>