67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000996 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  62.05 
 
 		 556 aa  684    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000996  predicted polymerase  100 
 
 		 559 aa  1137    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717686  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07053  hypothetical protein  83.9 
 
 		 566 aa  969    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  45.34 
 
 		 562 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  36.38 
 
 		 547 aa  339  5.9999999999999996e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  33.99 
 
 		 562 aa  277  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  32.68 
 
 		 556 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  31.21 
 
 		 563 aa  269  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  31.03 
 
 		 563 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  31.03 
 
 		 563 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  31.53 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  33.96 
 
 		 556 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  33.4 
 
 		 563 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  34.32 
 
 		 555 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  34.51 
 
 		 556 aa  262  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  30.88 
 
 		 562 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  30.88 
 
 		 562 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000204321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  30.88 
 
 		 562 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  34.52 
 
 		 556 aa  252  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  31.42 
 
 		 554 aa  244  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  32.02 
 
 		 555 aa  242  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  30.75 
 
 		 562 aa  223  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  28.47 
 
 		 551 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  28.4 
 
 		 552 aa  193  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  28.19 
 
 		 544 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000393022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  26.93 
 
 		 546 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  24.49 
 
 		 546 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  28.47 
 
 		 545 aa  154  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  27.08 
 
 		 534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  26.42 
 
 		 538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  27.89 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  25.81 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  28.78 
 
 		 542 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  27.95 
 
 		 461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  26.63 
 
 		 622 aa  114  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  24.74 
 
 		 660 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  26.31 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  24.79 
 
 		 611 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  30.2 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  29.5 
 
 		 463 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  26.3 
 
 		 467 aa  94.4  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  34.23 
 
 		 459 aa  94  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000175912  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  27.11 
 
 		 656 aa  90.9  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  28.91 
 
 		 527 aa  87  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  24.7 
 
 		 532 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  25.7 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  26.32 
 
 		 520 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  27.15 
 
 		 603 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  28.97 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  28.64 
 
 		 501 aa  77.8  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  26.86 
 
 		 603 aa  76.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  25.3 
 
 		 629 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  24.57 
 
 		 634 aa  75.5  0.000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  26.07 
 
 		 529 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  24.72 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0394  hypothetical protein  30.15 
 
 		 543 aa  71.2  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000249945  normal  0.153411 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  21.58 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  28.97 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0823  hypothetical protein  29.02 
 
 		 691 aa  67.4  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00604121  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0429  hypothetical protein  28.57 
 
 		 574 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  25.81 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4099  protein of unknown function DUF342  26.09 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000308473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  24.25 
 
 		 653 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  26.2 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  22.34 
 
 		 728 aa  53.9  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  24.63 
 
 		 525 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  22.12 
 
 		 509 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>