61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1718 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  773    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  50.27 
 
 		 381 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  51.06 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  41.98 
 
 		 378 aa  289  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2318  hypothetical protein  31.05 
 
 		 371 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575561 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  34.05 
 
 		 530 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  27.27 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  25.55 
 
 		 611 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  27.3 
 
 		 656 aa  106  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  27.4 
 
 		 532 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  24.73 
 
 		 622 aa  99.8  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  26.91 
 
 		 542 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  24.14 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  27.03 
 
 		 463 aa  97.1  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  25.63 
 
 		 527 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  24.01 
 
 		 467 aa  90.1  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  26.73 
 
 		 653 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  25 
 
 		 546 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  25.21 
 
 		 459 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000175912  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  27.18 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  26.83 
 
 		 563 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  26.83 
 
 		 563 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  26.83 
 
 		 563 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  25.45 
 
 		 545 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  23.1 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  27.27 
 
 		 555 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  24.22 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  24.51 
 
 		 556 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  26.1 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  25.55 
 
 		 555 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  24.92 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  24.68 
 
 		 562 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  27.23 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  26.76 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000204321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  26.76 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  26.76 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  27.71 
 
 		 538 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  25.34 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  24.38 
 
 		 456 aa  66.2  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  25.56 
 
 		 556 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  25.08 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  21.33 
 
 		 578 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  25.36 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  24.83 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  24.93 
 
 		 556 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  25.21 
 
 		 634 aa  63.2  0.000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  25.35 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  23.18 
 
 		 629 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  21.65 
 
 		 544 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000393022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  26.37 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  29.14 
 
 		 603 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  23.97 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  25.11 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  21.27 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  23.57 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  24.55 
 
 		 562 aa  57  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  24.69 
 
 		 484 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  26.16 
 
 		 455 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  25.13 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  22.47 
 
 		 501 aa  46.6  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  21.81 
 
 		 547 aa  43.5  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>