38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2721 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2721  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  273  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138465  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3360  hypothetical protein  68.42 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3422  hypothetical protein  68.42 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3371  hypothetical protein  68.42 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.393757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12268  hypothetical protein  70.68 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3750  hypothetical protein  68.42 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0311338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2783  hypothetical protein  67.67 
 
 		 158 aa  190  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3117  hypothetical protein  74.44 
 
 		 144 aa  173  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3503  hypothetical protein  59.12 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1647  hypothetical protein  60.63 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10320  hypothetical protein  61.72 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0882  hypothetical protein  59.38 
 
 		 149 aa  156  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.279065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2357  hypothetical protein  56.59 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0589181  normal  0.0271384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1335  hypothetical protein  61.65 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00689765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7041  hypothetical protein  60.77 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4793  hypothetical protein  55.91 
 
 		 140 aa  143  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2944  hypothetical protein  52.76 
 
 		 141 aa  137  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1994  hypothetical protein  51.59 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3369  hypothetical protein  54.14 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.385063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1511  hypothetical protein  53.97 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.321414  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3609  hypothetical protein  53.38 
 
 		 145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1559  hypothetical protein  58.59 
 
 		 169 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.002298  decreased coverage  0.00736578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2202  hypothetical protein  53.03 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2463  hypothetical protein  54.55 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0185856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3338  hypothetical protein  56.35 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418504  normal  0.184123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1965  hypothetical protein  49.22 
 
 		 156 aa  130  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.614259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2131  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.198502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3055  hypothetical protein  46.97 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14150  hypothetical protein  46.88 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2055  hypothetical protein  53.38 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.179057  normal  0.0122223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1862  hypothetical protein  46.97 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0102357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2146  hypothetical protein  41.27 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1811  hypothetical protein  43.41 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346622  hitchhiker  0.00995382 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16720  hypothetical protein  50.83 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09350  hypothetical protein  42.65 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0113  hypothetical protein  43.08 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1126  hypothetical protein  42.75 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12070  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.160655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>