38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2944 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2944  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  279  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170204  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1965  hypothetical protein  78.01 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.614259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1647  hypothetical protein  66.43 
 
 
142 aa  184  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204887  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2357  hypothetical protein  66.43 
 
 
144 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0589181  normal  0.0271384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7041  hypothetical protein  64.29 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0882  hypothetical protein  58.22 
 
 
149 aa  161  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.279065  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3503  hypothetical protein  55.71 
 
 
141 aa  146  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2131  hypothetical protein  55.91 
 
 
136 aa  140  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.198502  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10320  hypothetical protein  56.45 
 
 
138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1994  hypothetical protein  49.66 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1511  hypothetical protein  51.06 
 
 
137 aa  134  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.321414  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3371  hypothetical protein  53.97 
 
 
140 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.393757  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3422  hypothetical protein  53.97 
 
 
140 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3360  hypothetical protein  53.97 
 
 
140 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2146  hypothetical protein  51.06 
 
 
140 aa  130  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14150  hypothetical protein  52.24 
 
 
137 aa  130  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4793  hypothetical protein  50.71 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1811  hypothetical protein  47.01 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346622  hitchhiker  0.00995382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3369  hypothetical protein  56.03 
 
 
145 aa  127  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.385063  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3609  hypothetical protein  55.32 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1335  hypothetical protein  55.04 
 
 
144 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00689765  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2721  hypothetical protein  52.76 
 
 
138 aa  123  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3750  hypothetical protein  52.85 
 
 
142 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0311338  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12268  hypothetical protein  47.83 
 
 
158 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2783  hypothetical protein  50.79 
 
 
158 aa  120  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3055  hypothetical protein  47.86 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2463  hypothetical protein  51.49 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0185856  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0113  hypothetical protein  43.8 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1559  hypothetical protein  57.48 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.002298  decreased coverage  0.00736578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3338  hypothetical protein  49.29 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418504  normal  0.184123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2202  hypothetical protein  48.51 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3117  hypothetical protein  49.29 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1126  hypothetical protein  44.72 
 
 
140 aa  114  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1862  hypothetical protein  47.86 
 
 
145 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0102357 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09350  hypothetical protein  40.85 
 
 
143 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12070  hypothetical protein  45.71 
 
 
141 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.160655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16720  hypothetical protein  52.1 
 
 
139 aa  103  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2055  hypothetical protein  47.14 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.179057  normal  0.0122223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>