38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12070 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12070  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  279  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.160655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12268  hypothetical protein  47.37 
 
 
158 aa  114  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2357  hypothetical protein  45.14 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0589181  normal  0.0271384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3360  hypothetical protein  45.19 
 
 
140 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3422  hypothetical protein  45.19 
 
 
140 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3371  hypothetical protein  45.19 
 
 
140 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.393757  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0882  hypothetical protein  46.56 
 
 
149 aa  107  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.279065  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1647  hypothetical protein  44.68 
 
 
142 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10320  hypothetical protein  44.36 
 
 
138 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2944  hypothetical protein  45.71 
 
 
141 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170204  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1511  hypothetical protein  45.59 
 
 
137 aa  103  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.321414  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2783  hypothetical protein  44.53 
 
 
158 aa  103  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7041  hypothetical protein  45.07 
 
 
142 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3750  hypothetical protein  45.16 
 
 
142 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0311338  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2131  hypothetical protein  43.75 
 
 
136 aa  100  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.198502  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2146  hypothetical protein  41.84 
 
 
140 aa  100  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1965  hypothetical protein  45.71 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.614259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3503  hypothetical protein  43.28 
 
 
141 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4793  hypothetical protein  43.26 
 
 
140 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1335  hypothetical protein  42.86 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00689765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3338  hypothetical protein  43.26 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418504  normal  0.184123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1994  hypothetical protein  44.35 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14150  hypothetical protein  44.19 
 
 
137 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1811  hypothetical protein  39.58 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346622  hitchhiker  0.00995382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2721  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3117  hypothetical protein  40.29 
 
 
144 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1559  hypothetical protein  44.36 
 
 
169 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.002298  decreased coverage  0.00736578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3609  hypothetical protein  43.75 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3055  hypothetical protein  37.5 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3369  hypothetical protein  43.06 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.385063  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16720  hypothetical protein  43.09 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1862  hypothetical protein  37.5 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0102357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2202  hypothetical protein  38.35 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2463  hypothetical protein  38.35 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0185856  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09350  hypothetical protein  40.14 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0113  hypothetical protein  35.43 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1126  hypothetical protein  34.15 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2055  hypothetical protein  39.24 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.179057  normal  0.0122223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>