38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1965 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1965  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  310  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.614259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2944  hypothetical protein  78.01 
 
 		 141 aa  219  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1647  hypothetical protein  70.71 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204887  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2357  hypothetical protein  64.79 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0589181  normal  0.0271384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7041  hypothetical protein  67.86 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0882  hypothetical protein  61.64 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.279065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3503  hypothetical protein  58.59 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1811  hypothetical protein  52.24 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346622  hitchhiker  0.00995382 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2146  hypothetical protein  53.19 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2131  hypothetical protein  54.26 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.198502  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1511  hypothetical protein  51.06 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.321414  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14150  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1994  hypothetical protein  54.76 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4793  hypothetical protein  50.71 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10320  hypothetical protein  53.6 
 
 		 138 aa  130  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3609  hypothetical protein  56.03 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3369  hypothetical protein  55.32 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.385063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3371  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.393757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3422  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3360  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445137  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3055  hypothetical protein  48.57 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2463  hypothetical protein  52.99 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0185856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1559  hypothetical protein  59.06 
 
 		 169 aa  118  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.002298  decreased coverage  0.00736578 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0113  hypothetical protein  44.96 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1335  hypothetical protein  54.33 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00689765  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12268  hypothetical protein  44.93 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2202  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1126  hypothetical protein  44.72 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2721  hypothetical protein  49.22 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138465  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09350  hypothetical protein  45.11 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3750  hypothetical protein  47.66 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0311338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2783  hypothetical protein  46.88 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16720  hypothetical protein  53.72 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3338  hypothetical protein  47.14 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418504  normal  0.184123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1862  hypothetical protein  47.86 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0102357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3117  hypothetical protein  46.1 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12070  hypothetical protein  45.71 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.160655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2055  hypothetical protein  46.09 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.179057  normal  0.0122223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>