38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2357 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2357  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  285  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0589181  normal  0.0271384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1647  hypothetical protein  73.94 
 
 
142 aa  214  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7041  hypothetical protein  78.17 
 
 
142 aa  209  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0882  hypothetical protein  68.92 
 
 
149 aa  205  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.279065  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3503  hypothetical protein  65.67 
 
 
141 aa  185  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2944  hypothetical protein  66.43 
 
 
141 aa  179  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170204  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1965  hypothetical protein  64.79 
 
 
156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.614259  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10320  hypothetical protein  61.54 
 
 
138 aa  161  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3422  hypothetical protein  59.69 
 
 
140 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3371  hypothetical protein  59.69 
 
 
140 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.393757  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3360  hypothetical protein  59.69 
 
 
140 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3750  hypothetical protein  59.69 
 
 
142 aa  156  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0311338  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2783  hypothetical protein  59.84 
 
 
158 aa  154  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1994  hypothetical protein  57.48 
 
 
147 aa  153  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3369  hypothetical protein  60.14 
 
 
145 aa  150  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.385063  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3609  hypothetical protein  60.14 
 
 
145 aa  150  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2131  hypothetical protein  59.06 
 
 
136 aa  147  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.198502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1811  hypothetical protein  56.15 
 
 
144 aa  147  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346622  hitchhiker  0.00995382 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12268  hypothetical protein  53.24 
 
 
158 aa  147  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1511  hypothetical protein  55.32 
 
 
137 aa  146  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.321414  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4793  hypothetical protein  53.9 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1559  hypothetical protein  68.5 
 
 
169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.002298  decreased coverage  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1335  hypothetical protein  58.82 
 
 
144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00689765  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3055  hypothetical protein  53.52 
 
 
145 aa  143  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3338  hypothetical protein  57.94 
 
 
142 aa  141  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418504  normal  0.184123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2146  hypothetical protein  53.9 
 
 
140 aa  141  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14150  hypothetical protein  56.69 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2463  hypothetical protein  52.99 
 
 
139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0185856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2721  hypothetical protein  56.59 
 
 
138 aa  136  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2202  hypothetical protein  49.25 
 
 
139 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3117  hypothetical protein  54.61 
 
 
144 aa  130  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0113  hypothetical protein  50.4 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16720  hypothetical protein  54.92 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1862  hypothetical protein  52.11 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0102357 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1126  hypothetical protein  46.4 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12070  hypothetical protein  45.14 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.160655 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09350  hypothetical protein  44.19 
 
 
143 aa  104  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2055  hypothetical protein  52 
 
 
142 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.179057  normal  0.0122223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>