38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1647 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1647  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204887  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2357  hypothetical protein  73.94 
 
 
144 aa  214  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0589181  normal  0.0271384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7041  hypothetical protein  73.24 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0882  hypothetical protein  66.89 
 
 
149 aa  194  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.279065  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1965  hypothetical protein  70.71 
 
 
156 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.614259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2944  hypothetical protein  66.43 
 
 
141 aa  184  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170204  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3503  hypothetical protein  64.08 
 
 
141 aa  178  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1994  hypothetical protein  56.55 
 
 
147 aa  163  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3055  hypothetical protein  57.75 
 
 
145 aa  163  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10320  hypothetical protein  60.8 
 
 
138 aa  161  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4793  hypothetical protein  57.45 
 
 
140 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3360  hypothetical protein  58.91 
 
 
140 aa  156  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3422  hypothetical protein  58.91 
 
 
140 aa  156  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3371  hypothetical protein  58.91 
 
 
140 aa  156  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.393757  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1559  hypothetical protein  73.02 
 
 
169 aa  154  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.002298  decreased coverage  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1511  hypothetical protein  58.52 
 
 
137 aa  152  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.321414  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3609  hypothetical protein  63.5 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2131  hypothetical protein  60.16 
 
 
136 aa  150  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.198502  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3369  hypothetical protein  63.5 
 
 
145 aa  150  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.385063  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1335  hypothetical protein  62.79 
 
 
144 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00689765  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2146  hypothetical protein  55.56 
 
 
140 aa  147  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3750  hypothetical protein  56.59 
 
 
142 aa  147  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0311338  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3338  hypothetical protein  59.71 
 
 
142 aa  146  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418504  normal  0.184123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2721  hypothetical protein  60.63 
 
 
138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2783  hypothetical protein  55.04 
 
 
158 aa  143  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1811  hypothetical protein  54.2 
 
 
144 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346622  hitchhiker  0.00995382 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12268  hypothetical protein  51.8 
 
 
158 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1862  hypothetical protein  55.63 
 
 
145 aa  140  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0102357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2463  hypothetical protein  55.22 
 
 
139 aa  140  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0185856  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14150  hypothetical protein  54.69 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3117  hypothetical protein  56.03 
 
 
144 aa  137  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2202  hypothetical protein  52.24 
 
 
139 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16720  hypothetical protein  59.02 
 
 
139 aa  128  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09350  hypothetical protein  44.37 
 
 
143 aa  120  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0113  hypothetical protein  45.8 
 
 
138 aa  118  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1126  hypothetical protein  44 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12070  hypothetical protein  44.68 
 
 
141 aa  106  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.160655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2055  hypothetical protein  50.7 
 
 
142 aa  100  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.179057  normal  0.0122223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>