39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1862 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1862  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  282  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0102357 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3055  hypothetical protein  91.72 
 
 		 145 aa  263  8.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0882  hypothetical protein  55.41 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.279065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1647  hypothetical protein  55.63 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204887  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3503  hypothetical protein  57.25 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2357  hypothetical protein  52.11 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0589181  normal  0.0271384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7041  hypothetical protein  56.34 
 
 		 142 aa  140  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10320  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4793  hypothetical protein  49.65 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3360  hypothetical protein  46.43 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3422  hypothetical protein  46.43 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3371  hypothetical protein  46.43 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.393757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1335  hypothetical protein  54.55 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00689765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1811  hypothetical protein  48.46 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346622  hitchhiker  0.00995382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2944  hypothetical protein  47.86 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1965  hypothetical protein  47.86 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.614259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3750  hypothetical protein  44.93 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0311338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2783  hypothetical protein  45.52 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3369  hypothetical protein  49.32 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.385063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2146  hypothetical protein  45.93 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12268  hypothetical protein  44.6 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3609  hypothetical protein  48.63 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.630736  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14150  hypothetical protein  47.54 
 
 		 137 aa  115  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3338  hypothetical protein  47.52 
 
 		 142 aa  113  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418504  normal  0.184123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2202  hypothetical protein  45.67 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1994  hypothetical protein  47.62 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2463  hypothetical protein  45.67 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0185856  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2131  hypothetical protein  46.34 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.198502  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3117  hypothetical protein  49.24 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2721  hypothetical protein  46.97 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138465  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1511  hypothetical protein  45.38 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.321414  normal  0.0752552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1559  hypothetical protein  52.38 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.002298  decreased coverage  0.00736578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2055  hypothetical protein  50.38 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.179057  normal  0.0122223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16720  hypothetical protein  46.72 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09350  hypothetical protein  42.62 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0113  hypothetical protein  37.23 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1126  hypothetical protein  36.22 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12070  hypothetical protein  37.5 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.160655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2849  hypothetical protein  23.53 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.561423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>