24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3871 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3871  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  521  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3956  hypothetical protein  32.68 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5034  hypothetical protein  32.82 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6907  hypothetical protein  33.82 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364037 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5103  hypothetical protein  34.19 
 
 
262 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3784  hypothetical protein  34.63 
 
 
265 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.575497 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3180  hypothetical protein  34.85 
 
 
306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2419  hypothetical protein  31.82 
 
 
292 aa  111  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147203  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3031  hypothetical protein  29.2 
 
 
251 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207128  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3587  hypothetical protein  32.63 
 
 
241 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1423  hypothetical protein  28.51 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1702  hypothetical protein  29.55 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00453742  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1469  hypothetical protein  28.51 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0937  hypothetical protein  28.39 
 
 
303 aa  95.5  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306753  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1532  hypothetical protein  24.82 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0272744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2479  hypothetical protein  25.38 
 
 
445 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000256372  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1240  hypothetical protein  24.03 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0913  hypothetical protein  28.81 
 
 
329 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.180523  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0902  hypothetical protein  25.73 
 
 
306 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1497  hypothetical protein  25.11 
 
 
307 aa  52  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.450079  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1904  hypothetical protein  26.42 
 
 
298 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.815763  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04291  hypothetical protein  22.69 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2635  hypothetical protein  24.43 
 
 
319 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.406552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3828  Chromosome segregation ATPase-like protein  20.49 
 
 
785 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>