19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1532 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1532  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0272744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1904  hypothetical protein  29.43 
 
 		 298 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.815763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3180  hypothetical protein  30.71 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3871  hypothetical protein  25.42 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3587  hypothetical protein  30.58 
 
 		 241 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2419  hypothetical protein  26.14 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147203  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3956  hypothetical protein  26.41 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6907  hypothetical protein  26.01 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.364037 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3784  hypothetical protein  24.91 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.575497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5034  hypothetical protein  22.86 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5103  hypothetical protein  23.19 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1423  hypothetical protein  26.07 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1702  hypothetical protein  25.86 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00453742  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1469  hypothetical protein  26.07 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0937  hypothetical protein  28.19 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1400  hypothetical protein  43.08 
 
 		 79 aa  49.3  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3031  hypothetical protein  26.32 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207128  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2635  hypothetical protein  25.2 
 
 		 319 aa  46.2  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.406552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2479  hypothetical protein  22.56 
 
 		 445 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000256372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>