19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3587 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3587  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3180  hypothetical protein  37.12 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6907  hypothetical protein  31.56 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.364037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3956  hypothetical protein  31.51 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5103  hypothetical protein  29.78 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3871  hypothetical protein  32.2 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3784  hypothetical protein  33.04 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.575497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2419  hypothetical protein  29.31 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147203  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0937  hypothetical protein  27.93 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5034  hypothetical protein  26.47 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1532  hypothetical protein  30.2 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0272744  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0912  hypothetical protein  50.85 
 
 		 112 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.357882  normal  0.203298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3031  hypothetical protein  25.4 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207128  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1702  hypothetical protein  27.73 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00453742  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1423  hypothetical protein  25.73 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1469  hypothetical protein  25.73 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0913  hypothetical protein  33.71 
 
 		 329 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.180523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1497  hypothetical protein  28.09 
 
 		 307 aa  42.4  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.450079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3519  hypothetical protein  24.59 
 
 		 272 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.514135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>