16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6907 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6907  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364037 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5103  hypothetical protein  72.9 
 
 
262 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3784  hypothetical protein  59.62 
 
 
265 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.575497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3956  hypothetical protein  31.17 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3871  hypothetical protein  35.04 
 
 
261 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3587  hypothetical protein  32 
 
 
241 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3180  hypothetical protein  30.09 
 
 
306 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5771  hypothetical protein  48.11 
 
 
176 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148222  normal  0.178418 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1423  hypothetical protein  29.52 
 
 
284 aa  85.5  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1469  hypothetical protein  29.89 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2419  hypothetical protein  27.97 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147203  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1702  hypothetical protein  29.24 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00453742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0937  hypothetical protein  31.09 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306753  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5034  hypothetical protein  28.51 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3031  hypothetical protein  28.14 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207128  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1532  hypothetical protein  25.64 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0272744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>