17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1469 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1469  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  547  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1423  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1702  hypothetical protein  78.57 
 
 
283 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00453742  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3784  hypothetical protein  31.16 
 
 
265 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.575497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3871  hypothetical protein  28.51 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3956  hypothetical protein  28.23 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2419  hypothetical protein  27.13 
 
 
292 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147203  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6907  hypothetical protein  29.89 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364037 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5103  hypothetical protein  27.8 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5034  hypothetical protein  26.43 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3031  hypothetical protein  28.45 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207128  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0937  hypothetical protein  27.23 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306753  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3180  hypothetical protein  25.21 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3587  hypothetical protein  27.27 
 
 
241 aa  52  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2479  hypothetical protein  24.55 
 
 
445 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000256372  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1240  hypothetical protein  19.65 
 
 
273 aa  45.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1532  hypothetical protein  26.07 
 
 
271 aa  42.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0272744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>