25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3519 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3519  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  549  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.514135  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03105  hypothetical protein  68.16 
 
 
270 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1585  hypothetical protein  23.71 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1988  hypothetical protein  20.89 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1847  hypothetical protein  21.82 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00110245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2641  hypothetical protein  22.53 
 
 
293 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.332337  normal  0.0619929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1833  hypothetical protein  21.82 
 
 
287 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000548981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2444  hypothetical protein  21.82 
 
 
287 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1235  hypothetical protein  20.64 
 
 
299 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110146  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1881  hypothetical protein  21.82 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000377612  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2000  hypothetical protein  23.41 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000240648  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1340  hypothetical protein  21.65 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00430506  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4325  hypothetical protein  25.94 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2406  hypothetical protein  21.45 
 
 
307 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23744  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2199  hypothetical protein  21.67 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2273  hypothetical protein  20.07 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.308758  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2196  hypothetical protein  20.07 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1743  hypothetical protein  19.57 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2513  hypothetical protein  18.84 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1480  hypothetical protein  19.19 
 
 
303 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2311  hypothetical protein  20.88 
 
 
290 aa  48.9  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.141718  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3730  hypothetical protein  25.49 
 
 
279 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.63 
 
 
616 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  30.63 
 
 
616 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3587  hypothetical protein  24.84 
 
 
241 aa  42  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>