48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3193 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3193  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0868  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  75.86 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2642  hypothetical protein  53.03 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1604  hypothetical protein  50.67 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0762  hypothetical protein  50.67 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.125216 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1681  hypothetical protein  51.52 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.747789  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1379  hypothetical protein  51.52 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0913  hypothetical protein  41.03 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08161  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  48 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1979  hypothetical protein  49.37 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4341  hypothetical protein  46.84 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06111  hypothetical protein  41.98 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.46293 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1886  hypothetical protein  41.98 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2649  hypothetical protein  44.26 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05591  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  40 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8574  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.29 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224719  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05821  hypothetical protein  29.11 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0556  hypothetical protein  28 
 
 		 79 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.198822  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0401  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.33 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.685477  hitchhiker  0.00013147 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0848  hypothetical protein  38.57 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0497  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.56 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.715149  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06121  hypothetical protein  26.67 
 
 		 79 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.428426  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06201  hypothetical protein  28.75 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2043  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1412  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.11 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0351237 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2557  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.78 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0417  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.89 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0306191  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4024  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.95 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1646  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.36 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0328743 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0898  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.18 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1536  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.89 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0631  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  25.97 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00151713  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0128  hypothetical protein  45.83 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4166  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  27.71 
 
 		 117 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2208  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.86 
 
 		 95 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0290031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1438  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.11 
 
 		 96 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000681938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4140  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  27.63 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2696  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.24 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1891  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  27.85 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0206929  normal  0.972327 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0408  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.35 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000458544  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3348  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.24 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.107615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2817  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.23 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3581  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.34 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635691  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0438  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.87 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  28.75 
 
 		 225 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05422  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.95 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1245  4A-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  33.82 
 
 		 82 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.361508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0712  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.38 
 
 		 113 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>