35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0913 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0913  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1979  hypothetical protein  46.25 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2642  hypothetical protein  45 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4341  hypothetical protein  46.25 
 
 
88 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1681  hypothetical protein  45.95 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.747789  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1379  hypothetical protein  45.95 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3193  hypothetical protein  41.03 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183625  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0762  hypothetical protein  40.74 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.125216 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05591  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  41.27 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1604  hypothetical protein  37.04 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08161  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  33.33 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0868  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.75 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06111  hypothetical protein  30.38 
 
 
87 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.46293 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1886  hypothetical protein  30.38 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2649  hypothetical protein  43.55 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06201  hypothetical protein  32.43 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06121  hypothetical protein  28.77 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.428426  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0848  hypothetical protein  33.96 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05821  hypothetical protein  29.33 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0556  hypothetical protein  33.96 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.198822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  21.79 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1412  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  24.39 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0351237 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05551  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.61 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.593929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0401  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.75 
 
 
112 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.685477  hitchhiker  0.00013147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0680  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  25.93 
 
 
120 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0707  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  25.93 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.289633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01523  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.65 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3347  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  27.55 
 
 
98 aa  41.2  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4174  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  23.17 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0128  hypothetical protein  47.73 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1320  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.97 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197021  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.35 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.18996  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0134  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.58 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05181  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  22.99 
 
 
96 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00643072  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05471  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  22.99 
 
 
96 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.375908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>