23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0762 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0762  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  174  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.125216 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1604  hypothetical protein  75.61 
 
 
89 aa  134  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08161  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  69.88 
 
 
83 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06111  hypothetical protein  58.02 
 
 
87 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.46293 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1886  hypothetical protein  58.02 
 
 
87 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05591  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  55.56 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3193  hypothetical protein  50.67 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2642  hypothetical protein  39.76 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1979  hypothetical protein  49.37 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4341  hypothetical protein  46.84 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0913  hypothetical protein  40.74 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1379  hypothetical protein  45.71 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1681  hypothetical protein  45.71 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.747789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2649  hypothetical protein  52.83 
 
 
79 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0848  hypothetical protein  37.5 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0868  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.21 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0556  hypothetical protein  31.65 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.198822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05821  hypothetical protein  30.77 
 
 
79 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06121  hypothetical protein  28.21 
 
 
79 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.428426  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06201  hypothetical protein  40.74 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1245  4A-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  28.17 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8574  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.84 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2043  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  41.07 
 
 
107 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>