24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1979 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1979  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  181  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4341  hypothetical protein  87.5 
 
 
88 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0913  hypothetical protein  46.25 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2642  hypothetical protein  46.77 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0868  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.84 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0762  hypothetical protein  49.37 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.125216 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3193  hypothetical protein  49.37 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183625  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06111  hypothetical protein  38.37 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.46293 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1886  hypothetical protein  38.37 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05591  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  38.27 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08161  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  45.57 
 
 
83 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1604  hypothetical protein  46.84 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1681  hypothetical protein  45.71 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.747789  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1379  hypothetical protein  45.71 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2649  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06201  hypothetical protein  31.51 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05821  hypothetical protein  28.95 
 
 
79 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0556  hypothetical protein  28.77 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.198822  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06121  hypothetical protein  28.77 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.428426  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0848  hypothetical protein  37.04 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1412  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.92 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0351237 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0631  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.87 
 
 
113 aa  40.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00151713  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2085  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.49 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2173  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.49 
 
 
116 aa  40  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>