22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1379 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1681  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.747789  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1379  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0868  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  47.83 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3193  hypothetical protein  51.52 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2642  hypothetical protein  52.73 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0913  hypothetical protein  45.95 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0762  hypothetical protein  45.71 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.125216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1979  hypothetical protein  45.71 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08161  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  39.13 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1604  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4341  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05591  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  46.3 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06111  hypothetical protein  37.14 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.46293 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1886  hypothetical protein  37.14 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2649  hypothetical protein  47.83 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0128  hypothetical protein  47.73 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06121  hypothetical protein  31.75 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.428426  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05821  hypothetical protein  34.92 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0556  hypothetical protein  30.16 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.198822  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06201  hypothetical protein  46.34 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0848  hypothetical protein  36.36 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8574  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.79 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>