20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1886 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1886  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06111  hypothetical protein  98.85 
 
 
87 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.46293 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0762  hypothetical protein  58.02 
 
 
83 aa  105  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.125216 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1604  hypothetical protein  56.79 
 
 
89 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08161  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  55.56 
 
 
83 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05591  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  54.43 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1979  hypothetical protein  38.37 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2642  hypothetical protein  34.62 
 
 
89 aa  62.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0848  hypothetical protein  41.03 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4341  hypothetical protein  36.05 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3193  hypothetical protein  41.98 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0913  hypothetical protein  30.38 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06121  hypothetical protein  36.84 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.428426  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06201  hypothetical protein  34.21 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0868  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.35 
 
 
93 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2649  hypothetical protein  44 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1379  hypothetical protein  37.14 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1681  hypothetical protein  37.14 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.747789  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0556  hypothetical protein  30.26 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.198822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05821  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>