33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0868 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0868  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  100 
 
 		 93 aa  191  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3193  hypothetical protein  75.86 
 
 		 92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183625  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1681  hypothetical protein  47.83 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.747789  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1379  hypothetical protein  47.83 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2642  hypothetical protein  40.66 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1979  hypothetical protein  46.84 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4341  hypothetical protein  44.3 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0762  hypothetical protein  43.21 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.125216 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0913  hypothetical protein  38.75 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1604  hypothetical protein  40.51 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08161  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  40.85 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05591  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  35.71 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06111  hypothetical protein  37.35 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.46293 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1886  hypothetical protein  37.35 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8574  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.82 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224719  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05821  hypothetical protein  32.88 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2649  hypothetical protein  43.86 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0556  hypothetical protein  30.14 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.198822  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06121  hypothetical protein  30.14 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.428426  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0128  hypothetical protein  48.98 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1245  4A-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  34.72 
 
 		 82 aa  48.1  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.361508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0497  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.34 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.715149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2043  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  45.1 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06201  hypothetical protein  32.86 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0417  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.57 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0306191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2557  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.85 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0438  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.91 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1536  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.79 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0848  hypothetical protein  31.43 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0898  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.63 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0492  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.76 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.032217  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1410  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.41 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2248  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.77 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00853902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>