46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2642 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2642  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  186  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08161  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  45.12 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0913  hypothetical protein  45 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3193  hypothetical protein  53.03 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183625  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05591  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  41.67 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1604  hypothetical protein  42.17 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1379  hypothetical protein  52.73 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1681  hypothetical protein  52.73 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.747789  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0762  hypothetical protein  39.76 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.125216 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0868  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40.66 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1979  hypothetical protein  46.77 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0556  hypothetical protein  32.43 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.198822  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1886  hypothetical protein  34.62 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4341  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06111  hypothetical protein  34.62 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.46293 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06201  hypothetical protein  34.25 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06121  hypothetical protein  31.08 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.428426  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05821  hypothetical protein  29.73 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0848  hypothetical protein  37.5 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2649  hypothetical protein  46.43 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8574  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.36 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224719  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4534  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.53 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0497  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.04 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.715149  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2429  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.76 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101892  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6480  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.23 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  0.280018 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0128  hypothetical protein  39.13 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1805  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.92 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.696832  normal  0.809401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2141  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.92 
 
 		 125 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.206758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1757  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.92 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1266  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.75 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.421777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0417  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0306191  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2406  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  27.71 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2208  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.73 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0290031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1849  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.77 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0456582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5747  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.12 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.674967  hitchhiker  0.0082739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1646  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.12 
 
 		 124 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000199305  normal  0.271517 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1412  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.65 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0351237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3348  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.14 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.107615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3381  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.33 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0604341  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0180  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.14 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0169  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.1 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2085  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.68 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2173  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.68 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3765  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.89 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.637482  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3519  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.03 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.777034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3581  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.33 
 
 		 96 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>