27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2669 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2669  hypothetical protein  100 
 
 
1448 aa  2823    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5099  hypothetical protein  54.48 
 
 
1584 aa  1264    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.962428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2802  hypothetical protein  28.82 
 
 
1404 aa  298  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0291891  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2871  hypothetical protein  28.88 
 
 
1404 aa  282  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1082  hypothetical protein  40 
 
 
1443 aa  182  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071648  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0631  SMC domain protein  29.25 
 
 
1365 aa  180  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0538  hypothetical protein  36.24 
 
 
1367 aa  171  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3975  hypothetical protein  38.07 
 
 
1411 aa  169  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5500  hypothetical protein  36.22 
 
 
1425 aa  164  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.0122145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0168  hypothetical protein  31.66 
 
 
1409 aa  159  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0869  hypothetical protein  37.83 
 
 
1354 aa  157  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0673993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1491  hypothetical protein  36.41 
 
 
1366 aa  149  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0487  hypothetical protein  35.77 
 
 
1406 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0302  ATPase  23.75 
 
 
1376 aa  141  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3861  hypothetical protein  36.26 
 
 
1347 aa  132  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2246  chromosome segregation ATPase-like protein  27.44 
 
 
1388 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0249  Chromosome segregation ATPase-like protein  27.44 
 
 
1350 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2612  hypothetical protein  27.14 
 
 
1427 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251677  normal  0.0907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2035  chromosome segregation ATPase-like protein  22.78 
 
 
1370 aa  115  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1180  SMC domain protein  29.76 
 
 
1353 aa  115  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0382  hypothetical protein  27.94 
 
 
1404 aa  113  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03694  hypothetical protein  31.16 
 
 
1376 aa  102  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1074  hypothetical protein  29.25 
 
 
1387 aa  94  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  22.81 
 
 
1123 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  21.25 
 
 
1130 aa  50.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0931  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.55 
 
 
2309 aa  46.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  21.99 
 
 
1109 aa  45.1  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>