25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3975 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03694  hypothetical protein  39.83 
 
 		 1376 aa  769    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3975  hypothetical protein  100 
 
 		 1411 aa  2753    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1082  hypothetical protein  47.65 
 
 		 1443 aa  1017    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1491  hypothetical protein  45.05 
 
 		 1366 aa  853    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0538  hypothetical protein  34.25 
 
 		 1367 aa  628  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2802  hypothetical protein  33.47 
 
 		 1404 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0291891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2871  hypothetical protein  33.4 
 
 		 1404 aa  473  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0487  hypothetical protein  48.95 
 
 		 1406 aa  418  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0168  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1409 aa  353  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2246  chromosome segregation ATPase-like protein  23.59 
 
 		 1388 aa  264  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1180  SMC domain protein  26.14 
 
 		 1353 aa  261  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2035  chromosome segregation ATPase-like protein  23.2 
 
 		 1370 aa  248  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0249  Chromosome segregation ATPase-like protein  21.71 
 
 		 1350 aa  240  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0382  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1404 aa  233  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3861  hypothetical protein  42.75 
 
 		 1347 aa  198  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5500  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1425 aa  182  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.0122145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0631  SMC domain protein  28.93 
 
 		 1365 aa  173  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0869  hypothetical protein  32.79 
 
 		 1354 aa  135  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0673993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0302  ATPase  30.75 
 
 		 1376 aa  135  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2612  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1427 aa  124  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251677  normal  0.0907 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2669  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1448 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5099  hypothetical protein  34.36 
 
 		 1584 aa  99  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.962428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1074  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1387 aa  77  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  20.15 
 
 		 1138 aa  50.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 		 267 aa  45.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>