25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1082 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03694  hypothetical protein  40.62 
 
 		 1376 aa  785    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0487  hypothetical protein  55.85 
 
 		 1406 aa  1206    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1082  hypothetical protein  100 
 
 		 1443 aa  2815    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3975  hypothetical protein  47.46 
 
 		 1411 aa  998    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1491  hypothetical protein  45.54 
 
 		 1366 aa  866    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0538  hypothetical protein  35.39 
 
 		 1367 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2802  hypothetical protein  31.99 
 
 		 1404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0291891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2871  hypothetical protein  31.92 
 
 		 1404 aa  446  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0168  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1409 aa  365  4e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2246  chromosome segregation ATPase-like protein  23.28 
 
 		 1388 aa  282  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5500  hypothetical protein  30.78 
 
 		 1425 aa  228  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.0122145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3861  hypothetical protein  44.72 
 
 		 1347 aa  201  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0249  Chromosome segregation ATPase-like protein  22.7 
 
 		 1350 aa  170  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0382  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1404 aa  162  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2612  hypothetical protein  41.24 
 
 		 1427 aa  162  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251677  normal  0.0907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0302  ATPase  35.45 
 
 		 1376 aa  155  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1180  SMC domain protein  33.84 
 
 		 1353 aa  153  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0631  SMC domain protein  35.64 
 
 		 1365 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0869  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1354 aa  144  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0673993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2669  hypothetical protein  33.45 
 
 		 1448 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2035  chromosome segregation ATPase-like protein  31.77 
 
 		 1370 aa  121  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5099  hypothetical protein  36.95 
 
 		 1584 aa  94.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.962428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1074  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1387 aa  75.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  27.24 
 
 		 1093 aa  48.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1121 aa  47.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>