23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03694 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03694  hypothetical protein  100 
 
 
1376 aa  2731    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1491  hypothetical protein  40.82 
 
 
1366 aa  737    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3975  hypothetical protein  39.07 
 
 
1411 aa  734    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0538  hypothetical protein  33.81 
 
 
1367 aa  580  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2871  hypothetical protein  31.59 
 
 
1404 aa  442  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2802  hypothetical protein  31.59 
 
 
1404 aa  443  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0291891  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0487  hypothetical protein  45.36 
 
 
1406 aa  348  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1082  hypothetical protein  49.34 
 
 
1443 aa  323  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071648  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0168  hypothetical protein  28.84 
 
 
1409 aa  265  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2246  chromosome segregation ATPase-like protein  21.71 
 
 
1388 aa  248  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0249  Chromosome segregation ATPase-like protein  22.5 
 
 
1350 aa  230  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3861  hypothetical protein  40.38 
 
 
1347 aa  194  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0382  hypothetical protein  25.36 
 
 
1404 aa  184  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2035  chromosome segregation ATPase-like protein  25.5 
 
 
1370 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0302  ATPase  34.83 
 
 
1376 aa  154  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2612  hypothetical protein  35.71 
 
 
1427 aa  146  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251677  normal  0.0907 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5099  hypothetical protein  28.72 
 
 
1584 aa  146  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.962428 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1180  SMC domain protein  33.08 
 
 
1353 aa  144  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5500  hypothetical protein  25.61 
 
 
1425 aa  132  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.0122145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0631  SMC domain protein  30.27 
 
 
1365 aa  120  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0869  hypothetical protein  29.33 
 
 
1354 aa  117  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0673993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2669  hypothetical protein  30.07 
 
 
1448 aa  92.8  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1074  hypothetical protein  27.54 
 
 
1387 aa  85.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>