23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0168 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2612  hypothetical protein  39.3 
 
 
1427 aa  685    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251677  normal  0.0907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0168  hypothetical protein  100 
 
 
1409 aa  2742    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5500  hypothetical protein  36.37 
 
 
1425 aa  679    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.0122145 
 
 
-
 
NC_003296  RS03694  hypothetical protein  28.83 
 
 
1376 aa  285  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2802  hypothetical protein  34.1 
 
 
1404 aa  281  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0291891  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2871  hypothetical protein  34.1 
 
 
1404 aa  280  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3975  hypothetical protein  37.25 
 
 
1411 aa  202  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1082  hypothetical protein  38.14 
 
 
1443 aa  199  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071648  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2246  chromosome segregation ATPase-like protein  25.03 
 
 
1388 aa  194  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3861  hypothetical protein  38.12 
 
 
1347 aa  175  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0249  Chromosome segregation ATPase-like protein  21.53 
 
 
1350 aa  169  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1491  hypothetical protein  33.5 
 
 
1366 aa  159  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2035  chromosome segregation ATPase-like protein  22.92 
 
 
1370 aa  155  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2669  hypothetical protein  34.96 
 
 
1448 aa  152  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0302  ATPase  22.93 
 
 
1376 aa  148  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0487  hypothetical protein  38.4 
 
 
1406 aa  145  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0631  SMC domain protein  34.12 
 
 
1365 aa  138  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0538  hypothetical protein  30.96 
 
 
1367 aa  138  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1180  SMC domain protein  30.53 
 
 
1353 aa  127  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0382  hypothetical protein  29.18 
 
 
1404 aa  124  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0869  hypothetical protein  30.87 
 
 
1354 aa  116  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0673993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1074  hypothetical protein  29.41 
 
 
1387 aa  87  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5099  hypothetical protein  34.16 
 
 
1584 aa  74.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.962428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>