25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0869 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0869  hypothetical protein  100 
 
 
1354 aa  2600    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0673993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2802  hypothetical protein  28.92 
 
 
1404 aa  288  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0291891  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2871  hypothetical protein  29.06 
 
 
1404 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03694  hypothetical protein  29.09 
 
 
1376 aa  261  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5500  hypothetical protein  27.78 
 
 
1425 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.0122145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2669  hypothetical protein  37.83 
 
 
1448 aa  174  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2246  chromosome segregation ATPase-like protein  20.92 
 
 
1388 aa  157  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1082  hypothetical protein  37.59 
 
 
1443 aa  155  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071648  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1180  SMC domain protein  27.58 
 
 
1353 aa  148  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0487  hypothetical protein  32.18 
 
 
1406 aa  148  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3975  hypothetical protein  32.79 
 
 
1411 aa  143  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225862 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3861  hypothetical protein  29.7 
 
 
1347 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0249  Chromosome segregation ATPase-like protein  22.04 
 
 
1350 aa  136  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2612  hypothetical protein  31.6 
 
 
1427 aa  132  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251677  normal  0.0907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0302  ATPase  28.68 
 
 
1376 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0382  hypothetical protein  28.21 
 
 
1404 aa  117  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0631  SMC domain protein  30.18 
 
 
1365 aa  116  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2035  chromosome segregation ATPase-like protein  25.18 
 
 
1370 aa  110  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0168  hypothetical protein  30.87 
 
 
1409 aa  110  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1491  hypothetical protein  41.98 
 
 
1366 aa  105  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332853  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5099  hypothetical protein  35.6 
 
 
1584 aa  96.3  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.962428 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0538  hypothetical protein  28.9 
 
 
1367 aa  95.1  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1074  hypothetical protein  26.69 
 
 
1387 aa  78.2  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  26.55 
 
 
1113 aa  49.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  28.67 
 
 
1207 aa  48.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>