29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2871 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2802  hypothetical protein  99.79 
 
 
1404 aa  2752    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0291891  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2871  hypothetical protein  100 
 
 
1404 aa  2757    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3975  hypothetical protein  33.2 
 
 
1411 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225862 
 
 
-
 
NC_003296  RS03694  hypothetical protein  31.79 
 
 
1376 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3861  hypothetical protein  54.44 
 
 
1347 aa  347  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1082  hypothetical protein  34.71 
 
 
1443 aa  311  5e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071648  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1491  hypothetical protein  35.41 
 
 
1366 aa  280  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0168  hypothetical protein  33.86 
 
 
1409 aa  263  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0631  SMC domain protein  32.38 
 
 
1365 aa  246  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5500  hypothetical protein  31.2 
 
 
1425 aa  246  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.0122145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2246  chromosome segregation ATPase-like protein  26.72 
 
 
1388 aa  235  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0487  hypothetical protein  39.56 
 
 
1406 aa  220  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0382  hypothetical protein  29.32 
 
 
1404 aa  214  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1180  SMC domain protein  29.58 
 
 
1353 aa  205  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0249  Chromosome segregation ATPase-like protein  23.49 
 
 
1350 aa  205  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0538  hypothetical protein  41.67 
 
 
1367 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5099  hypothetical protein  30 
 
 
1584 aa  176  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.962428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0302  ATPase  31.83 
 
 
1376 aa  174  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2669  hypothetical protein  33.97 
 
 
1448 aa  165  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2612  hypothetical protein  34.07 
 
 
1427 aa  157  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251677  normal  0.0907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0869  hypothetical protein  30.39 
 
 
1354 aa  134  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0673993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2035  chromosome segregation ATPase-like protein  25.24 
 
 
1370 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1074  hypothetical protein  29.91 
 
 
1387 aa  116  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  27.21 
 
 
1159 aa  46.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  27.21 
 
 
1159 aa  47  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  27.21 
 
 
1159 aa  46.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  24.19 
 
 
1113 aa  45.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  29.13 
 
 
1145 aa  45.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  27.76 
 
 
1118 aa  45.1  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>