23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5500 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2612  hypothetical protein  43.17 
 
 
1427 aa  890    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251677  normal  0.0907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0168  hypothetical protein  36.26 
 
 
1409 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5500  hypothetical protein  100 
 
 
1425 aa  2849    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.0122145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2802  hypothetical protein  31.58 
 
 
1404 aa  241  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0291891  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2871  hypothetical protein  31.58 
 
 
1404 aa  240  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0538  hypothetical protein  39.13 
 
 
1367 aa  189  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1082  hypothetical protein  40 
 
 
1443 aa  178  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071648  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0487  hypothetical protein  36.79 
 
 
1406 aa  174  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2246  chromosome segregation ATPase-like protein  22.6 
 
 
1388 aa  173  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2669  hypothetical protein  36.22 
 
 
1448 aa  163  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0249  Chromosome segregation ATPase-like protein  22.11 
 
 
1350 aa  146  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1180  SMC domain protein  31.66 
 
 
1353 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0631  SMC domain protein  37.99 
 
 
1365 aa  130  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0302  ATPase  31.27 
 
 
1376 aa  127  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0382  hypothetical protein  22.72 
 
 
1404 aa  127  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2035  chromosome segregation ATPase-like protein  23.36 
 
 
1370 aa  125  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03694  hypothetical protein  25.23 
 
 
1376 aa  122  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3861  hypothetical protein  33.46 
 
 
1347 aa  115  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3975  hypothetical protein  30.4 
 
 
1411 aa  112  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1491  hypothetical protein  29.58 
 
 
1366 aa  110  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0869  hypothetical protein  28.21 
 
 
1354 aa  105  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0673993  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5099  hypothetical protein  30 
 
 
1584 aa  87.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.962428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1074  hypothetical protein  29.35 
 
 
1387 aa  79.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>