76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2483 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2483  photosystem antenna protein-like  100 
 
 		 368 aa  737    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2485  photosystem antenna protein-like  61.99 
 
 		 522 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2484  photosystem antenna protein-like  56.62 
 
 		 343 aa  350  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.965644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1060  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  60.28 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000366993  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0053  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  59.93 
 
 		 460 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000498494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0055  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  59.93 
 
 		 460 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0578  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  61.17 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0513  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  57.65 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0656  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  57.86 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1243  photosynthetic II protein PsbC  59.57 
 
 		 459 aa  308  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0217  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  57.29 
 
 		 473 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0294116  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1795  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  50.62 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08421  photosystem II PsbC protein (CP43)  51.22 
 
 		 464 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1542  iron-stress chlorophyll-binding protein  48.75 
 
 		 342 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398653  normal  0.0103257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1667  photosystem antenna protein-like  47.81 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00889751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1257  photosystem II PsbC protein (CP43)  49.29 
 
 		 460 aa  265  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0172037  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13501  photosystem II PsbC protein (CP43)  49.29 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.151398  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13251  photosystem II PsbC protein (CP43)  49.29 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  unclonable  0.000121028  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13351  photosystem II PsbC protein (CP43)  49.29 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16081  photosystem II PsbC protein (CP43)  46.71 
 
 		 460 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.548682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0768  photosystem II PsbC protein (CP43)  46.71 
 
 		 460 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12341  photosystem II PsbC protein (CP43)  47.93 
 
 		 460 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.606702  normal  0.098859 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0667  photosynthetic II protein PsbC  51.79 
 
 		 462 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.329399  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1993  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  52.77 
 
 		 462 aa  260  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2434  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  48.12 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000346716  hitchhiker  0.0000000117955 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1005  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  42.01 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1590  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  41.19 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10047  hitchhiker  0.00277314 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06931  light-harvesting complex protein  40.62 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06541  light-harvesting complex protein  40.62 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06831  light-harvesting complex protein  40.62 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0627  light-harvesting complex protein  40 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08471  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  40.8 
 
 		 352 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.679252  hitchhiker  0.00174435 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09521  hypothetical protein  40.31 
 
 		 352 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722234 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0215  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  40.8 
 
 		 352 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1271  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  40.06 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0702178  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13631  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  40.38 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13421  hypothetical protein  40.06 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13721  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  40.06 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07351  light-harvesting complex protein  36.53 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.112937 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06881  light-harvesting complex protein  35.71 
 
 		 349 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0066  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbA  35.71 
 
 		 349 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14531  hypothetical protein  36.23 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358475 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15601  hypothetical protein  34.13 
 
 		 362 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.963648 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0722  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbE  34.13 
 
 		 362 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.683508  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10131  light-harvesting complex protein  39.51 
 
 		 350 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11571  hypothetical protein  33.83 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0991489 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15611  hypothetical protein  34.45 
 
 		 354 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.732375  normal  0.917864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0723  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  34.45 
 
 		 354 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.543048  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0719  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  34.56 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.17492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15561  hypothetical protein  34.56 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.95378 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14281  hypothetical protein  32.94 
 
 		 365 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517015 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11601  hypothetical protein  34.36 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0985613 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11631  hypothetical protein  34.86 
 
 		 352 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0312993 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15541  hypothetical protein  32.32 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0717  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbH  32.32 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0718  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbC  30.24 
 
 		 370 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17721  light-harvesting complex protein  36.2 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15551  hypothetical protein  30.24 
 
 		 370 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0321  photosystem II PsbB protein (CP47)  26.39 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1864  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  27.57 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03401  photosystem II PsbB protein (CP47)  26.04 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03471  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.27 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03391  photosystem II PsbB protein (CP47)  26.04 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0452672  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0470  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  26.34 
 
 		 519 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0861  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  26.59 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000036456  decreased coverage  0.00000114007 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4113  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  26.83 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0697  photosystem II core light harvesting protein  26.59 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000016119  normal  0.0946335 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1572  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  26.19 
 
 		 508 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1507  photosystem antenna protein-like  26.19 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000124352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3069  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  25.79 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4666  photosystem antenna protein-like  24.9 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0622483  normal  0.0120025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3051  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  25.79 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000997071  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22121  photosystem II PsbB protein (CP47)  24.83 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04051  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.05 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.644071 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1692  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.05 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03501  photosystem II PsbB protein (CP47)  25.64 
 
 		 518 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>