76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_17721 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_17721  light-harvesting complex protein  100 
 
 		 368 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09521  hypothetical protein  69.71 
 
 		 352 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722234 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0215  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  66.86 
 
 		 352 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1271  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  65.14 
 
 		 352 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0702178  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08471  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  66.57 
 
 		 352 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.679252  hitchhiker  0.00174435 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13721  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  65.62 
 
 		 352 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13631  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  65.06 
 
 		 352 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13421  hypothetical protein  64.49 
 
 		 352 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0627  light-harvesting complex protein  58.64 
 
 		 352 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06831  light-harvesting complex protein  56.66 
 
 		 352 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06541  light-harvesting complex protein  56.66 
 
 		 352 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07351  light-harvesting complex protein  57.67 
 
 		 351 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.112937 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06881  light-harvesting complex protein  56.21 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0066  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbA  55.93 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06931  light-harvesting complex protein  56.09 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15601  hypothetical protein  54.02 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.963648 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0722  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbE  54.02 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.683508  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1590  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  56.86 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10047  hitchhiker  0.00277314 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15611  hypothetical protein  55.49 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.732375  normal  0.917864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0723  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  55.49 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.543048  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14281  hypothetical protein  54.25 
 
 		 365 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517015 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15561  hypothetical protein  56.98 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.95378 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11571  hypothetical protein  57.06 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0991489 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1005  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  54.86 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0719  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  56.98 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.17492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15541  hypothetical protein  56.3 
 
 		 351 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0717  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbH  56.3 
 
 		 351 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10131  light-harvesting complex protein  59.49 
 
 		 350 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14531  hypothetical protein  55.33 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358475 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11601  hypothetical protein  58.31 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0985613 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15551  hypothetical protein  53.31 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0718  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbC  53.31 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11631  hypothetical protein  54.87 
 
 		 352 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0312993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1795  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  44.74 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1542  iron-stress chlorophyll-binding protein  46.99 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398653  normal  0.0103257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2434  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  46.55 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000346716  hitchhiker  0.0000000117955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1667  photosystem antenna protein-like  46.47 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00889751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2484  photosystem antenna protein-like  36.84 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.965644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2485  photosystem antenna protein-like  35.12 
 
 		 522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0578  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  34.95 
 
 		 459 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0055  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  33.98 
 
 		 460 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1060  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  34.63 
 
 		 461 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000366993  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0053  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  33.98 
 
 		 460 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000498494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0513  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  33.76 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0656  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  34.3 
 
 		 461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1243  photosynthetic II protein PsbC  35.28 
 
 		 459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13251  photosystem II PsbC protein (CP43)  35.48 
 
 		 460 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  unclonable  0.000121028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13501  photosystem II PsbC protein (CP43)  35.48 
 
 		 460 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.151398  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13351  photosystem II PsbC protein (CP43)  35.48 
 
 		 460 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0217  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  37.89 
 
 		 473 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0294116  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1257  photosystem II PsbC protein (CP43)  35.81 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0172037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2483  photosystem antenna protein-like  34.36 
 
 		 368 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16081  photosystem II PsbC protein (CP43)  33.55 
 
 		 460 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.548682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0768  photosystem II PsbC protein (CP43)  33.55 
 
 		 460 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08421  photosystem II PsbC protein (CP43)  35.24 
 
 		 464 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0667  photosynthetic II protein PsbC  35.39 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.329399  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1993  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  35.39 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12341  photosystem II PsbC protein (CP43)  34.12 
 
 		 460 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.606702  normal  0.098859 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04051  photosystem II PsbB protein (CP47)  31.34 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.644071 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1692  photosystem II PsbB protein (CP47)  31.34 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03471  photosystem II PsbB protein (CP47)  30.63 
 
 		 507 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0321  photosystem II PsbB protein (CP47)  30.28 
 
 		 507 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03401  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.93 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03391  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.93 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0452672  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0470  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  30.46 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03501  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.25 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1864  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  31.03 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0861  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  31.25 
 
 		 510 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000036456  decreased coverage  0.00000114007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22121  photosystem II PsbB protein (CP47)  26.07 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1507  photosystem antenna protein-like  31.03 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000124352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0697  photosystem II core light harvesting protein  30.68 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000016119  normal  0.0946335 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4666  photosystem antenna protein-like  30.51 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0622483  normal  0.0120025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3069  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  29.55 
 
 		 508 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3051  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  29.55 
 
 		 508 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000997071  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4113  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  27.69 
 
 		 509 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1572  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  26.38 
 
 		 508 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>