71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_22121 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4113  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  71.83 
 
 
509 aa  768    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04051  photosystem II PsbB protein (CP47)  77.8 
 
 
507 aa  819    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.644071 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22121  photosystem II PsbB protein (CP47)  100 
 
 
510 aa  1044    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03401  photosystem II PsbB protein (CP47)  79.22 
 
 
507 aa  849    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03471  photosystem II PsbB protein (CP47)  79.61 
 
 
507 aa  848    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03501  photosystem II PsbB protein (CP47)  75.38 
 
 
518 aa  798    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03391  photosystem II PsbB protein (CP47)  78.82 
 
 
507 aa  847    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0452672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4666  photosystem antenna protein-like  72.28 
 
 
508 aa  759    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0622483  normal  0.0120025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0697  photosystem II core light harvesting protein  74.51 
 
 
508 aa  786    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000016119  normal  0.0946335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3069  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  73.12 
 
 
508 aa  776    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0321  photosystem II PsbB protein (CP47)  78.63 
 
 
507 aa  846    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1572  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  74.06 
 
 
508 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0470  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  82.45 
 
 
519 aa  865    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1864  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  82.45 
 
 
519 aa  863    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0861  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  74.31 
 
 
510 aa  786    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000036456  decreased coverage  0.00000114007 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1692  photosystem II PsbB protein (CP47)  77.8 
 
 
507 aa  819    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1507  photosystem antenna protein-like  73.21 
 
 
509 aa  771    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000124352  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3051  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  73.12 
 
 
508 aa  776    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000997071  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0578  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  25.1 
 
 
459 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0513  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  24.81 
 
 
459 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0053  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  24.9 
 
 
460 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000498494  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0055  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  24.9 
 
 
460 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16081  photosystem II PsbC protein (CP43)  25 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.548682  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0768  photosystem II PsbC protein (CP43)  25.08 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12341  photosystem II PsbC protein (CP43)  26.54 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.606702  normal  0.098859 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13251  photosystem II PsbC protein (CP43)  26.44 
 
 
460 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  unclonable  0.000121028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13501  photosystem II PsbC protein (CP43)  26.44 
 
 
460 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.151398  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13351  photosystem II PsbC protein (CP43)  26.44 
 
 
460 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0656  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  27.24 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0217  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  24.7 
 
 
473 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0294116  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1257  photosystem II PsbC protein (CP43)  26.14 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0172037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2485  photosystem antenna protein-like  26.69 
 
 
522 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90279  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2484  photosystem antenna protein-like  27.82 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.965644  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1060  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  23.74 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000366993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1243  photosynthetic II protein PsbC  23.08 
 
 
459 aa  70.5  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2113  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08421  photosystem II PsbC protein (CP43)  24.09 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0667  photosynthetic II protein PsbC  26.14 
 
 
462 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.329399  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1993  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  26.14 
 
 
462 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0215  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  30.92 
 
 
352 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08471  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  30.92 
 
 
352 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.679252  hitchhiker  0.00174435 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09521  hypothetical protein  25 
 
 
352 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722234 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1271  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  25.08 
 
 
352 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0702178  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1590  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  24.29 
 
 
345 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10047  hitchhiker  0.00277314 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17721  light-harvesting complex protein  32.28 
 
 
368 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1795  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  25 
 
 
359 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14531  hypothetical protein  30.95 
 
 
355 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358475 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1005  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  24.16 
 
 
359 aa  55.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13631  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  24.16 
 
 
352 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13721  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  24.16 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06881  light-harvesting complex protein  28.65 
 
 
349 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2483  photosystem antenna protein-like  24.5 
 
 
368 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0066  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbA  28.65 
 
 
349 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13421  hypothetical protein  24.5 
 
 
352 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07351  light-harvesting complex protein  35 
 
 
351 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.112937 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0627  light-harvesting complex protein  28.25 
 
 
352 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0723  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  30.29 
 
 
354 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.543048  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15611  hypothetical protein  30.29 
 
 
354 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.732375  normal  0.917864 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15551  hypothetical protein  28.57 
 
 
370 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203138  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0718  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbC  28.57 
 
 
370 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06831  light-harvesting complex protein  37.31 
 
 
352 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06541  light-harvesting complex protein  37.31 
 
 
352 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06931  light-harvesting complex protein  37.31 
 
 
352 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14281  hypothetical protein  27.72 
 
 
365 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517015 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0722  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbE  27.57 
 
 
362 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.683508  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15601  hypothetical protein  27.57 
 
 
362 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.963648 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10131  light-harvesting complex protein  44.68 
 
 
350 aa  47  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1667  photosystem antenna protein-like  23.19 
 
 
344 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00889751  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11571  hypothetical protein  27.84 
 
 
361 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0991489 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11631  hypothetical protein  28.57 
 
 
352 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0312993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0717  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbH  28.98 
 
 
351 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15541  hypothetical protein  28.98 
 
 
351 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>