17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1117 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1117  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  977    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00643446  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1634  hypothetical protein  38.46 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1376  hypothetical protein  36.25 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.98949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1996  hypothetical protein  32.14 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2023  hypothetical protein  31.47 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2554  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1466  cell wall hydrolase/autolysin  28.15 
 
 		 627 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000100817  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  23.86 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.6 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00159133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  20.77 
 
 		 344 aa  47.4  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  24.62 
 
 		 627 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.29 
 
 		 706 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0589  cell wall hydrolase/autolysin  24.41 
 
 		 612 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4727  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.43 
 
 		 619 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.26499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0604  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.41 
 
 		 612 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1316  hypothetical protein  35.63 
 
 		 240 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.812237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1287  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>