21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_2554 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2554  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  352  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1634  hypothetical protein  54.03 
 
 
236 aa  134  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1466  cell wall hydrolase/autolysin  32.59 
 
 
627 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000100817  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  35.48 
 
 
627 aa  62  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.29 
 
 
619 aa  58.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00159133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3123  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.13 
 
 
332 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1117  hypothetical protein  33.05 
 
 
492 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00643446  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0861  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
631 aa  55.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000195536  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.71 
 
 
424 aa  54.7  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4727  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
619 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.26499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0589  cell wall hydrolase/autolysin  29.59 
 
 
612 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1798  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.63 
 
 
623 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0604  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.59 
 
 
612 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594044  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.25 
 
 
338 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.25 
 
 
338 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000534753  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  30.43 
 
 
442 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.81 
 
 
706 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.06 
 
 
287 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0435442  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.3 
 
 
344 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.21 
 
 
397 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5127  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.18 
 
 
496 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498717  normal  0.873024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>