13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1376 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1376  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  380  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.98949  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1117  hypothetical protein  32.37 
 
 
492 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00643446  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2023  hypothetical protein  30.99 
 
 
252 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1996  hypothetical protein  30.99 
 
 
219 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1648  hypothetical protein  30.77 
 
 
239 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1287  hypothetical protein  44.23 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1316  hypothetical protein  44.23 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.812237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2542  hypothetical protein  33.96 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  43.94 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0444  hypothetical protein  28.15 
 
 
227 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.636334 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  37.88 
 
 
413 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  41.43 
 
 
413 aa  42.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0342  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.11917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>