14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0444 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0444  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  441  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.636334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2542  hypothetical protein  31.9 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1316  hypothetical protein  29.35 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.812237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1287  hypothetical protein  28.26 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  36.36 
 
 
413 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2500  hypothetical protein  26.62 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.255083  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1648  hypothetical protein  31.52 
 
 
239 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1717  hypothetical protein  29.41 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532829  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  26.83 
 
 
414 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1996  hypothetical protein  30.53 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2023  hypothetical protein  30.53 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  29.27 
 
 
413 aa  52.4  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2735  hypothetical protein  31.9 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.071454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1376  hypothetical protein  27.41 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.98949  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>