14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1717 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1717  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  459  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532829  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2735  hypothetical protein  61.84 
 
 
226 aa  245  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.071454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1648  hypothetical protein  40.08 
 
 
239 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2542  hypothetical protein  36.91 
 
 
223 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2023  hypothetical protein  33.2 
 
 
252 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1996  hypothetical protein  33.99 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1287  hypothetical protein  38.16 
 
 
240 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1316  hypothetical protein  37.72 
 
 
240 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.812237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  38.8 
 
 
413 aa  88.2  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2500  hypothetical protein  31.94 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.255083  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  32.62 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  31.38 
 
 
414 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0444  hypothetical protein  27.81 
 
 
227 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.636334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  29.94 
 
 
431 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>