33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1634 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1634  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  466  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2554  hypothetical protein  54.03 
 
 		 176 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1466  cell wall hydrolase/autolysin  33.73 
 
 		 627 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000100817  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.86 
 
 		 619 aa  77  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00159133  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.47 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0861  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.72 
 
 		 631 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000195536  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0589  cell wall hydrolase/autolysin  32.73 
 
 		 612 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0604  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.73 
 
 		 612 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4727  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 		 619 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.26499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  30.71 
 
 		 627 aa  68.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3123  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.2 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1117  hypothetical protein  38.46 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00643446  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1798  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.43 
 
 		 623 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  31.58 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.52 
 
 		 706 aa  59.3  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.62 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.62 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000534753  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.27 
 
 		 344 aa  53.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.9 
 
 		 397 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2670  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.71 
 
 		 447 aa  48.9  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.2261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73040  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.31 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.487189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2772  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.9 
 
 		 443 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00294465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.48 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0435442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1129  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.74 
 
 		 523 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.418715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5657  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.52 
 
 		 390 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1709  cell wall hydrolase/autolysin  30.56 
 
 		 419 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1046  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.35 
 
 		 416 aa  42  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0326494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3228  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.35 
 
 		 416 aa  42  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0709021  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0994  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.35 
 
 		 416 aa  42  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.367182  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0142  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.25 
 
 		 603 aa  42.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.454848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1274  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.23 
 
 		 497 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.730541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3004  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.18 
 
 		 413 aa  42  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.695553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3811  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.33 
 
 		 417 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145796  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>