21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3119 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3119  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0838846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4384  hypothetical protein  47.21 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0319  hypothetical protein  44.76 
 
 		 288 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.454861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0606  hypothetical protein  36.84 
 
 		 341 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.480028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3649  hypothetical protein  54.05 
 
 		 217 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0788974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1429  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.72 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0894635  hitchhiker  0.000989669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3267  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  53.19 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1691  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  34.72 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.176877  unclonable  0.000000000719685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0496  DNA uptake-like protein  34.25 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1737  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40.74 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.33 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4872  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  35.59 
 
 		 313 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1008  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.55 
 
 		 114 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000463906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0313  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  35.44 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0283813  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1142  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat-containing protein  46.67 
 
 		 315 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal  0.935531 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  40 
 
 		 279 aa  42  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13270  DNA uptake protein  36.36 
 
 		 301 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0826  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  44.9 
 
 		 355 aa  42  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0217462  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2156  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  34.43 
 
 		 90 aa  41.6  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.367346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1931  hypothetical protein  28.24 
 
 		 295 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0688  Soluble ligand binding domain protein  38.1 
 
 		 308 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.108278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>