17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0606 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0606  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  686    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.480028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0319  hypothetical protein  41.28 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.454861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4384  hypothetical protein  38.89 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3119  hypothetical protein  36.84 
 
 		 230 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0838846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3649  hypothetical protein  37.25 
 
 		 217 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0788974  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12460  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  39.06 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0668  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.67 
 
 		 464 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0688  Soluble ligand binding domain protein  44.44 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.108278 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1122  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.67 
 
 		 235 aa  47  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.266281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  35.71 
 
 		 194 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1691  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.86 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.176877  unclonable  0.000000000719685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3267  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  44.26 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2552  helix-hairpin-helix motif protein  37.1 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00090  hypothetical protein  31.75 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0962  DNA uptake protein or related DNA-binding protein  33.33 
 
 		 109 aa  43.5  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  36.67 
 
 		 279 aa  43.5  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13270  DNA uptake protein  39.34 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>