36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1220 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1220  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  200  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3027  hypothetical protein  41.84 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3632  hypothetical protein  39.42 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000778847  hitchhiker  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0269  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1187  hypothetical protein  38 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0010  hypothetical protein  39.22 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.409313  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000384  hypothetical protein  32.04 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1401  Domain of unknown function DUF1840  40.62 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.563745  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1227  hypothetical protein  34.69 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2686  hypothetical protein  32 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2558  hypothetical protein  32 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2569  hypothetical protein  29.13 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3465  hypothetical protein  28.16 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.353832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0288  hypothetical protein  31.73 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5288  hypothetical protein  27.18 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704122  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4244  hypothetical protein  27.62 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0039  hypothetical protein  26.67 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5120  hypothetical protein  27.18 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335981  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0189  hypothetical protein  26.67 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0126  hypothetical protein  29.41 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0474  hypothetical protein  26.67 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0077  hypothetical protein  29.7 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1307  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0303736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6376  hypothetical protein  28.04 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0669  hypothetical protein  26.79 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2044  hypothetical protein  28.57 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0146  hypothetical protein  25.71 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0138  hypothetical protein  25.71 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3101  hypothetical protein  26.67 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.953527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0083  hypothetical protein  26.67 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0593  hypothetical protein  26.67 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1995  hypothetical protein  26.67 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2293  hypothetical protein  26.67 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0432  hypothetical protein  26.67 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0412  ribosomal protein L1  26.67 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0095  hypothetical protein  23.81 
 
 		 106 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>