50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0269 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0269  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  220  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3632  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000778847  hitchhiker  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3027  hypothetical protein  55.34 
 
 		 99 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000384  hypothetical protein  47.17 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2686  hypothetical protein  49.52 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2558  hypothetical protein  49.52 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1187  hypothetical protein  49.04 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1227  hypothetical protein  48.54 
 
 		 99 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0010  hypothetical protein  48.08 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.409313  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1220  hypothetical protein  38.46 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1307  hypothetical protein  57.28 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0303736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0077  hypothetical protein  40.38 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1401  Domain of unknown function DUF1840  42.16 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.563745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0095  hypothetical protein  35.78 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0126  hypothetical protein  32.04 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0039  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2569  hypothetical protein  33.65 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0474  hypothetical protein  31.86 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5288  hypothetical protein  32.69 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704122  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1148  hypothetical protein  30.28 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4244  hypothetical protein  31.86 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5120  hypothetical protein  33.65 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335981  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0189  hypothetical protein  28.32 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0669  hypothetical protein  29.2 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0461  hypothetical protein  33.64 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44765  normal  0.192979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0452  hypothetical protein  33.64 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384235  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6376  hypothetical protein  28.04 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3465  hypothetical protein  30.77 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.353832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1978  hypothetical protein  30.1 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0288  hypothetical protein  31.13 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2044  hypothetical protein  28.85 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0778  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1687  hypothetical protein  27.18 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5036  hypothetical protein  28.97 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137842  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0146  hypothetical protein  30.56 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0386  hypothetical protein  25.71 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0565373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0356  hypothetical protein  23.81 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0432  hypothetical protein  23.81 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0083  hypothetical protein  23.81 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0593  hypothetical protein  23.81 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0138  hypothetical protein  30.56 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3101  hypothetical protein  23.81 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.953527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1995  hypothetical protein  23.81 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0412  ribosomal protein L1  23.81 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2293  hypothetical protein  23.81 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0332  hypothetical protein  27.36 
 
 		 107 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2304  hypothetical protein  24.76 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2918  hypothetical protein  24.76 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2933  hypothetical protein  24.53 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6261  hypothetical protein  24.76 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>