49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0146 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0146  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0138  hypothetical protein  99.07 
 
 		 107 aa  217  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0288  hypothetical protein  85.98 
 
 		 105 aa  184  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0095  hypothetical protein  55.14 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0126  hypothetical protein  55.05 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0386  hypothetical protein  41.51 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0565373 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2918  hypothetical protein  42.45 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2304  hypothetical protein  42.45 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2933  hypothetical protein  42.45 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6261  hypothetical protein  41.51 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0669  hypothetical protein  42.74 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3101  hypothetical protein  39.62 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.953527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2293  hypothetical protein  39.62 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0432  hypothetical protein  39.62 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0412  ribosomal protein L1  39.62 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1995  hypothetical protein  39.62 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0593  hypothetical protein  39.62 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0356  hypothetical protein  39.62 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0083  hypothetical protein  39.62 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2967  hypothetical protein  41.51 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2830  hypothetical protein  41.51 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5120  hypothetical protein  42.06 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335981  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0474  hypothetical protein  40.19 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4244  hypothetical protein  39.25 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2569  hypothetical protein  41.12 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3465  hypothetical protein  41.96 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.353832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5288  hypothetical protein  41.96 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704122  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0189  hypothetical protein  35.51 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6376  hypothetical protein  39.09 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1687  hypothetical protein  31.78 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5036  hypothetical protein  38.32 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2044  hypothetical protein  33.94 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1978  hypothetical protein  31.78 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1148  hypothetical protein  33.04 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3632  hypothetical protein  26.17 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000778847  hitchhiker  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000384  hypothetical protein  31.43 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0332  hypothetical protein  27.93 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3027  hypothetical protein  25.71 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1227  hypothetical protein  28.57 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0595  hypothetical protein  32.71 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3615  hypothetical protein  39.77 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.265329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0039  hypothetical protein  32.65 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0778  hypothetical protein  31.82 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1220  hypothetical protein  25.71 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0461  hypothetical protein  31.82 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44765  normal  0.192979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0452  hypothetical protein  31.82 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384235  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0077  hypothetical protein  28.57 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3535  hypothetical protein  32.77 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.477092  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2558  hypothetical protein  28.04 
 
 		 105 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>