55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0126 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0126  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0095  hypothetical protein  79.25 
 
 
106 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0288  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603115  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4244  hypothetical protein  54.05 
 
 
108 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0146  hypothetical protein  55.05 
 
 
107 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0138  hypothetical protein  55.05 
 
 
107 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0474  hypothetical protein  53.15 
 
 
108 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0189  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2569  hypothetical protein  48.11 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3101  hypothetical protein  50.93 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.953527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2293  hypothetical protein  50.93 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0432  hypothetical protein  50.93 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0412  ribosomal protein L1  50.93 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1995  hypothetical protein  50.93 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0593  hypothetical protein  50.93 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0083  hypothetical protein  50.93 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0356  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2933  hypothetical protein  50.46 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2304  hypothetical protein  50.93 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5288  hypothetical protein  44.34 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704122  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2918  hypothetical protein  50.93 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0386  hypothetical protein  49.06 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0565373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6261  hypothetical protein  50.93 
 
 
107 aa  90.5  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5120  hypothetical protein  46.23 
 
 
106 aa  90.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335981  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3465  hypothetical protein  44.34 
 
 
106 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.353832  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6376  hypothetical protein  43.12 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2830  hypothetical protein  49.06 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0669  hypothetical protein  43.97 
 
 
115 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2967  hypothetical protein  48.11 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2044  hypothetical protein  41.51 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1978  hypothetical protein  38.53 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1148  hypothetical protein  41.82 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1687  hypothetical protein  37.38 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0778  hypothetical protein  42.34 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5036  hypothetical protein  41.9 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0595  hypothetical protein  39.05 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0332  hypothetical protein  34.26 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0452  hypothetical protein  43.52 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0461  hypothetical protein  43.52 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44765  normal  0.192979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3615  hypothetical protein  40.95 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.265329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3632  hypothetical protein  29.81 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000778847  hitchhiker  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3535  hypothetical protein  38.6 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.477092  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000384  hypothetical protein  27.18 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3027  hypothetical protein  29.81 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0039  hypothetical protein  35.19 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1227  hypothetical protein  30.1 
 
 
99 aa  50.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2686  hypothetical protein  28.57 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0269  hypothetical protein  32.04 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1187  hypothetical protein  28.57 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3956  hypothetical protein  31.53 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333987 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2558  hypothetical protein  26.67 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1220  hypothetical protein  29.41 
 
 
98 aa  47  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0077  hypothetical protein  31.07 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1401  Domain of unknown function DUF1840  25.49 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.563745  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0010  hypothetical protein  32.04 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.409313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>